瑞旭觀察：QSAR 模型軟件合集及詳解

定性（量）構效關系（QSAR），是使用數學模型來描述分子結構和某種生物活性之間的關系。這種關系，通常用一種算法將分子結構和分子的生物活性關聯起來，比如線性回歸、神經網絡、支持向量機、遺傳算法、決策樹等等。簡單的說，就是通過一些計算機模型來推測物質的某些性質或者活性。

常見的QSAR模型可分為規則模型（rule-based model）和統計模型（statistic-based model）。規則模型是基于專家經驗所制定的各種規則所建立的；而統計模型則是基于回歸分析、偏最小二乘、神經網絡等數學模型所建立。現階段常用的QSAR軟件包括OECD Toolbox，T.E.S.T，VEGA等往往包括了兩種模型，用戶可以根據需要選擇合適的模型。

以下針對市面上常用的免費QSAR軟件進行介紹，包括OECD Toolbox、EPI SUITE、ECOSAR等。

QSAR toolbox （官方下載鏈接點擊這里）

由OECD和ECHA聯合開發，共同擁有，在確保法規實施的同時，促進替代方法的使用。集成了大量的數據以及常見的QSAR模型，是一款功能非常強大的模型，能夠進行數據查找，read-across預測，相似度分析，QSAR預測等，可預測理化、毒理、環境歸趨和生態毒理相關性質，是ECHA推薦的預測皮膚致敏性QSAR軟件之一。

EPI Suite （官方下載鏈接點擊這里）

由US EPA開發，由一系列軟件集合而成，包括 KOWWIN™, AOPWIN™, HENRYWIN™, MPBPWIN™, BIOWIN™, BioHCwin, KOCWIN™, WSKOWWIN™, WATERNT™, BCFBAF™, HYDROWIN™, KOAWIN and AEROWIN™, WVOLWIN™, STPWIN™ ，LEV3EPI以及生態毒性預測ECOSAR™等十幾個子軟件，可預測理化、環境行為和生態毒理相關性質。

Toxtree （官方下載鏈接點擊這里 ）

由JRC開發，是一款功能齊全、靈活、用戶友好的開源應用程序，主要通過應用決策樹方法來估計毒性危害。目前業界應用場景最廣泛的是進行Cramer分類，并將結果應用于TTC。

T.E.S.T. （官方下載鏈接點擊這里）     

全稱是The Toxicity Estimation Software Tool，由US EPA開發，是為了讓用戶能夠使用定量結構-活性關系（QSAR）方法輕松評估化學品的毒性?？深A測理化、毒理和生態毒理相關性質。T.E.S.T方法包括了分層方法，單模型方法，群體貢獻法，最相鄰方法，一致性方法，作用模式法，能根據物質在各個模型中的適用性給出一個綜合的預測結果。

 VEGA （官方下載鏈接點擊這里）       

由意大利Istituto di Ricerche Farmacologiche Mario Negri IRCCS開發，可預測包括致突變性，生殖毒性，致癌性在內的毒理、以及部分理化、生態毒理、環境歸趨等十幾個終點，并支持輸出含預測結果的完整報告。

 Danish QSAR Database （官方下載鏈接點擊這里）     

由丹麥技術大學(DTU)開發，包含了650,000多個物質信息，200多個QSAR模型，可用于預測理化性質, 環境歸趨，蓄積性，生態毒理，代謝以及毒性等性質。

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